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利用微流控雙液滴裝置和CRISPR-Cas12a系統(tǒng)技術同時檢測兩種高危人乳頭瘤病毒亞型

       人乳頭瘤病毒(HPV)是一組環(huán)狀雙鏈DNA(dsDNA)病毒。HPV可以根據其致癌特性大致分為低風險和高風險亞型。HPV16和HPV18是兩種最常見的高危HPV亞型,引起70%的侵襲性宮頸癌。目前的HPV檢測方法存在操作繁瑣、通量低、設備復雜等缺點。

據麥姆斯咨詢報道,2023年2月1日,中科院精密測量院核酸復合物結構與功能研究組聯(lián)合武漢大學高等研究院胥國勇課題組在Analytical Chemistry在線發(fā)表了題為“Integrating CRISPR-Cas12a into a Microfluidic Dual-Droplet Device Enables Simultaneous Detection of HPV16 and HPV18”的研究論文。

基于CRISPR診斷系統(tǒng)的高特異性、敏感性以及微流控技術強大的液體控制能力,該研究開發(fā)了一種同時檢測HPV16和HPV18的微流控雙液滴裝置(M-D3)。該裝置通過結合CRISPR-Cas12a系統(tǒng)和多重RPA技術,可用于同時檢測HPV16和HPV18。在此液滴微流控平臺中,RPA對靶標先進行擴增,再利用CRISPR-Cas系統(tǒng)對擴增后的目標核酸進行檢測。由于M-D3可以平行產生兩組液滴,因此HPV16-crRNA/綠色報告分子和HPV18-crRNA/紅色報告分子可以分別封裝在相關液滴中。當有靶標存在時,將觸發(fā)Cas12a的非特異性切割活性,并對報告分子進行切割,生成相應的熒光信號,用于核酸檢測。根據熒光顏色和強度,我們可以區(qū)分樣本為HPV16/HPV18陽性或陰性。

圖一 M-D3檢測平臺的工作原理

該研究采用M-D3評估臨床人類患者樣本中的HPV16/HPV18感染情況。結果表明,M-D3芯片上讀取的結果與臨床結果高度一致,其敏感性和特異性分別為92.3%和100%。M-D3平臺具有操作方便、檢測時間短、靈敏度高的優(yōu)點,對傳染病的有效診斷具有重要意義,在多路核酸檢測方面具有巨大的應用潛力。

圖二 臨床患者樣本中的HPV16和HPV18在M-D3平臺同時檢測

武漢大學高等研究院胥國勇教授,中科院精密測量院劉買利院士團隊的李穎研究員、楊運煌研究員為通訊作者,武漢大學高等研究院/精密測量院聯(lián)培博士生趙銀為本文第一作者。該研究工作由國家自然科學基金、國家重點研發(fā)計劃提供經費支持。

論文鏈接:https://doi.org/10.1021/acs.analchem.2c05320

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